珍珠、鑽石版全部神奇寶貝棲息處
387-389 樹苗龜：主角PM之一，遊戲初期三選一得到 —LV.18→ 叢林龜 —LV.32→ 盆栽龜 |
390-392 小火猴：主角PM之一，遊戲初期三選一得到 —LV.14→ 火鬥猴 —LV.36→ 火聖猴 |
393-395 圓企鵝：主角PM之一，遊戲初期三選一得到 —LV.16→ 太子企鵝 —LV.36→ 鋼企鵝皇 |
396-398 胖胖鳥：神事湖畔，201號、202號、203號、204號、209號道路，豪宅門外草地，豪宅後院，狩獵區 —LV.14→ 撲克鳥：209號道路，豪宅門外草地，豪宅後院，律詩湖畔，鬼龍洞外草地 —LV.34→ 大胖鳥 |
399-400 呆狸鼠：神事湖畔，201號、202號、203號、204號、205號、208號、209號、211號道路，狩獵區，煉鐵廠—LV.15→呆河狸：208號、209號、210號、212號道路，英知湖畔，律詩湖畔，狩獵區，鬼龍洞外草地 |
401-402 帽蟋蟀：202號、203號、204號、206號、207號道路（清晨、晚間），206號道路（清晨） —LV.10→ 節律蟋蟀：206號、209號、210號、212號、214號、215號道路，律詩湖畔，狩獵區 |
403-405 亮電獸：202號、203號、204號道路，煉鐵廠 —LV.15→ 藍電獅：煉鐵廠 —LV.30→ 雷電獅 |
408-409 頭蓋龍：地下挖掘獲得化石復活（鑽石版限定） —LV.30→ 岩角龍 |
410-411 盾甲龍：地下挖掘獲得化石復活（珍珠版限定） —LV.30→ 鋼板龍 |
412-414 蓑衣蟲：搖樹 —LV.20→ 蓑葉蟲[雌性]/蓑葉蝶[雄性] |
415-416 三眼蜂：搖樹 —LV.21→ 蜂后[雌性限定] |
417 電栗鼠：205號道路，煉鐵廠，發電廠 |
418-419 雙尾水鼬：205號、213號、224號道路—LV.26→ 大水鼬：213號、218號、221號、222號、224號道路，230號水路，煉鐵廠，冠軍之路 |
420-421 櫻桃種子：搖樹 —LV.35→ 櫻桃花 |
422-423 鼻涕蟲：205號、213號、218號、221號、222號道路，發電廠，煉鐵廠—LV.30→ 泥沼蝸牛：213號、218號、221號、222號道路，230號水路，煉鐵廠 |
425-426 浮球鬼：每逢星期五在發電廠門口出現 —LV.28→ 浮燈鬼 |
427-428 卷耳兔：百岱森林 —親密度→ 垂耳兔 |
431-432 卷尾貓：218號、222號道路（珍珠版限定） —LV.38→ 富態貓：222號、229號道路 |
434-435 蓬毒鼬：206號、214號、221號道路（鑽石版限定）—LV.34→ 罐毒鼬：221號、225號道路（鑽石版限定） |
436-437 神通鏡：206號道路，中央山脈，鬼龍洞外部草地—LV.33→神通鐘：中央山脈，鬼龍洞外部草地 |
441 音符鸚鵡：222號、224號道路 |
442 鬼花盤：把道具“重要石頭”扔進209號道路的“禦靈塔”，然後在地下挖掘時與32人對話後，在209號道路“禦靈塔”捕捉 |
443-445 幼地龍：在206道路自行車道下方被擋住入口的洞穴內捕捉 —LV.24→ 卡貝地龍 —LV.48→ 鯊地龍 |
447-448 尼奧魯：從地圖西南的港口城市坐船去鋼鐵島，完成支線劇情後從NPC手中獲得蛋 —親密度+白天升級→ 魯卡裏奧 |
449-450 土河馬：抓齊全部形態的安農後與214道路上的洞穴內的NPC對話後，在洞內新開闢的地方捕捉 —LV.34→ 漏砂河馬：228號道路沙漠 |
451-452 毒爪蠍：狩獵區 —LV.40→ 毒龍蠍：狩獵區 |
453-454 格鬥毒蛙：狩獵區 —LV.37→ 武鬥毒蛙 |
455 捕蠅草怪：狩獵區 |
456-457 蝶尾魚：205號道路河流，218號、219號、221號道路，220號水路，港口市，鋼鐵島 —LV.31→ 鳳仙魚：205號道路河流，218號、219號、221號道路，220號水路，港口市，鋼鐵島 |
459-460 雪菜怪：216號、217號道路，英知湖畔，中央山脈外側 —LV.40→ 雪菜王：中央山脈外側 |
(聖獸) 479 電波鬼：觸發百岱森林鬼屋劇情後調查二樓屋內電視捕捉（晚間） |
480 約庫西（黃香菇）：放走三神獸劇情後，到英知湖中間島嶼內捕捉 |
481 艾穆利特（紅香菇）：放走三神獸劇情後，到神事湖中間島嶼內調查，見到後它會逃跑，之後在全地圖草叢隨機遇到 |
482 阿固儂（藍香菇）：放走三神獸劇情後，到律詩湖中間島嶼內捕捉 |
483 鑽石獸：劇情捕捉（鑽石版限定） |
484 珍珠獸：劇情捕捉（珍珠版限定） |
485 火鋼獸：在227道路火山深處捕捉 |
486 老聖柱：帶上寶石版三聖柱去雪城北側的神殿，在地下最深處捕捉 |
487 冥龍王：走214號道路右側新的道路，到達鬼龍洞，在洞的最深處捕捉 |
488 美夢神：在港口城市的港口左側房屋中引發劇情後，從港口坐船去滿月島，進入調查，見到後它會逃跑，之後在全地圖草叢隨機遇到 |
489 霏歐那：NO.490瑪那霏生蛋孵化得到 |
490 瑪那霏：收到從參加了2006年電影活動的POKEMON RANGER中傳來的蛋之後，孵化得到 |
491 噩夢神：今後舉辦活動時獲得，或利用BUG捕捉（不推薦使用） |
492 穗米刺蝟：今後舉辦活動時獲得，或利用BUG捕捉（不推薦使用） |
493 千手大神：今後舉辦活動時獲得 |